Dentre as finalidades do IHGI está a defesa no Patrimônio Cultural e Natural de Itaboraí, e fluminense. Desta forma, a instituição vem atuando também nas questões que envolvem a sustentabilidade ambiental, mudanças climáticas e formas de preservação ambiental afim de minimizar os impactos negativos e garantir um mundo melhor para as gerações futuras.
Assim, o Instituto Histórico e Geográfico Itaborahyense, por meio da sua Comissão de Patrimônio Natural e Natural, promove ações permanentes, em parceria com a comunidade local, alunos das redes de educação e poder público, como o mapeamento de áreas degradadas, palestras sobre a preservação ambiental, publicações em rede sociais que valorizam as potencialidades de áreas de preservação ambiental, com serras, morros, margens de rios e córregos, com destaque para a Serra do Barbosão, outrora conhecida historicamente como Tapacorá; Parque Natural Municipal Paleontológico de São José de Itaboraí; e o manguezal de Itambí, local de vivência de caiçara.
